Untuk kali pertama, Fakultas Ilmu Keolahragaan Universitas Negeri Yogyakarta menyelenggarakan PKKMB Program Magister dan Program Doktor, pada Sabtu 12 September 2020. Total mahasiswa S2 dan S3 yang berhasil diterima adalah 159 mahasiswa, dengan rincian S3 Ilmu Keolahragaan 31 mahasiswa, S2 Ilmu Keolahragaan 48 mahasiswa, S2 Pendidikan Kepelatihan Olahraga 43 mahasiswa, S2 Pendidikan Jasmani 37 mahasiswa.

Program Pengenalan Kehidupan Kampus Mahasiswa Baru dilaksanakan secara daring. Acara yang dimulai pada pukul 09.00 WIB ini dihadiri oleh segenap pimpinan FIK UNY di Ruang Sidang Utama lantai 3 GPLA. Kemudian dilanjutkan dengan pengenalan tiap prodi. Diawali dengan Prodi S3 Ilmu Keolahragaan, dilanjut Prodi S2 Ilmu Keolahragaan, kemudian S2 Pendidikan Kepelatihan Olahraga dan terakhir adalah S2 Pendidikan Jasmani. Masing-masing Koordinator Prodi S2 dan S3 memperkenalkan Prodinya masing-masing.

Selain itu, Mahasiswa Program Magister dan Doktor berkesempatan mendapatkan ilmu  tentang publikasi, yang materinya diberikan oleh Dr. Soni Nopembri, Ph.D. (PD)